Ostatecznie nie udało mi się rozwiązać problemu.
Zainstalowałem system od nowa + Visual Studio Community.
Co ciekawe po krótkim czasie przestał działać toolbox w vs (jego inicjalizacja wywalała vs)
Nie dało się odinstalować vs!
Po walce, kolejna reinstalka (przy okazji dowiedziałem się że klucz od win8pro-upgrade pasuje do obrazu iso win8.1pro
do utworzenia tutaj: http://windows.microsoft.com/en-us/windows-8/create-reset-refresh-media
i już nie muszę startować od siódemki -> upgrade do 8 -> milion łatek -> upgrade do 8.1)
Niewiarygodne, ale po kolejnej instalacji vs community, po jakimś czasie, nie było widać plików w Solution Explorerze (vs)
Znów nie można było odinstalować vs! Jakieś komunikaty że emulator wp ma nieważne certyfikaty.
Prawdopodobnie problemy te były spowodowane przez Windows Update i instalację całkiem sporej liczby łatek,
ale już po zainstalowaniu vs community.
Trzecia instalacja systemu w następującej kolejności i jak dotąd wszystko działa:
- instalacja systemu
- windows update (około 60 łatek)
- dopiero teraz vs community (nieinstalowanie emulatora wp)
- instalacja Windows Phone 8.1 Update 1 Emulators
Piszę, gdyby ktoś miał podobne problemy, bo straciłem kupę czasu na to.